พระสมเด็จวัดระฆังพิมพ์ใหญ่ยุคปลายเนื้อหนึกนุ่ม มวลสารมีให้เห็นไม่มากนัก เพราะเนื้อพระละเอียด เมื่อเข้ากล้องขยายสิ่งที่พบคือแคลไซต์ ก้อนผงรัตนตรัย และเม็ดผงพุทธคุณ ผงสองอย่างนี้ต่างกัน ผงรัตนตรัยมักจับตัวเป็นก้อนสีขาวด้าน ผงนี้คือผงที่ท่านสมเด็จโตเขียนอักขระ ตอนสอนหนังสือพระลูกศิษย์ของท่าน ท่านจะเก็บผงชอล์กเหล่านี้รวบรวมไว้เพื่อนำมาทำพระของท่าน ผงนี้เรียก "ผงรัตนตรัย" ส่วนผงพุทธคุณ หรือผงวิเศษจะเป็นเม็ดเล็กๆทรงกลมรี ต้องใช้กล้องขยายถึงจะเห็นชัด ลักษณะผิวแน่นเป็นมันสีขาวคล้ายเนื้อฟันของคน ผงนี้เป็นผงที่ท่านเขียนอักขระเลขยันต์ต่างๆ ซ้ำหลายครั้งที่เราเรียกกันว่า "ผงวิเศษทั้ง ๕" คือผงปถมัง ผงอิทธิเจ ผงพุทธคุณ ผงมหาราช ผงตรีนิสิงเห ผงเหล่านี้เป็นผงสำคัญ หรือผงหลักในการสร้างพระสมเด็จ ขาดไม่ได้เลย ท่านสมเด็จโตบอกว่าพระของท่านสำเร็จตั้งแต่เป็นผงแล้ว.